Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc30Q8BVF4 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc30Q8BVF4 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc30Q8BVF4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc30Q8BVF4 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc30Q8BVF4 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc30Q8BVF4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc30Q8BVF4 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc30Q8BVF4 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc30Q8BVF4 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc30Q8BVF4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc30Q8BVF4 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc30Q8BVF4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc30Q8BVF4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc30Q8BVF4 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc30Q8BVF4 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc30Q8BVF4 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc30Q8BVF4 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc30Q8BVF4 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc30Q8BVF4 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc30Q8BVF4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc30Q8BVF4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc30Q8BVF4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc30Q8BVF4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc30Q8BVF4 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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