Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ57

Gm10600, Predicted gene 10600, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10600Q8BQ57 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10600Q8BQ57 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms