Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.4Q85ZW8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms