Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Amigo1Q80ZD8 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Amigo1Q80ZD8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Amigo1Q80ZD8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Amigo1Q80ZD8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Amigo1Q80ZD8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Amigo1Q80ZD8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Amigo1Q80ZD8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Amigo1Q80ZD8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Amigo1Q80ZD8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Amigo1Q80ZD8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Amigo1Q80ZD8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Amigo1Q80ZD8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Amigo1Q80ZD8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Amigo1Q80ZD8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Amigo1Q80ZD8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Amigo1Q80ZD8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Amigo1Q80ZD8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Amigo1Q80ZD8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms