Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Lrfn4Q80XU8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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Lrfn4Q80XU8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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