Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ttc28Q80XJ3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ttc28Q80XJ3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ttc28Q80XJ3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ttc28Q80XJ3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ttc28Q80XJ3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ttc28Q80XJ3 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms