Protein–RNA interactions for Protein: Q80WJ1

Ggn, Gametogenetin, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GgnQ80WJ1 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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GgnQ80WJ1 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
GgnQ80WJ1 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
GgnQ80WJ1 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
GgnQ80WJ1 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
GgnQ80WJ1 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
GgnQ80WJ1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GgnQ80WJ1 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
GgnQ80WJ1 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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GgnQ80WJ1 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GgnQ80WJ1 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GgnQ80WJ1 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GgnQ80WJ1 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
GgnQ80WJ1 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GgnQ80WJ1 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GgnQ80WJ1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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GgnQ80WJ1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GgnQ80WJ1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GgnQ80WJ1 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
GgnQ80WJ1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GgnQ80WJ1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GgnQ80WJ1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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GgnQ80WJ1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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GgnQ80WJ1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
GgnQ80WJ1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
GgnQ80WJ1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
GgnQ80WJ1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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GgnQ80WJ1 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GgnQ80WJ1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GgnQ80WJ1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GgnQ80WJ1 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
GgnQ80WJ1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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GgnQ80WJ1 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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GgnQ80WJ1 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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GgnQ80WJ1 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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GgnQ80WJ1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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GgnQ80WJ1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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GgnQ80WJ1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GgnQ80WJ1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GgnQ80WJ1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GgnQ80WJ1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GgnQ80WJ1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GgnQ80WJ1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GgnQ80WJ1 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GgnQ80WJ1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GgnQ80WJ1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GgnQ80WJ1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GgnQ80WJ1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GgnQ80WJ1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GgnQ80WJ1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GgnQ80WJ1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
GgnQ80WJ1 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
GgnQ80WJ1 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GgnQ80WJ1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GgnQ80WJ1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GgnQ80WJ1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GgnQ80WJ1 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GgnQ80WJ1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GgnQ80WJ1 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms