Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms