Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prrc2bQ7TPM1 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms