Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms