Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usp49Q6P9L4 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms