Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Smchd1Q6P5D8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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