Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
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