Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms