Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms