Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms