Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Sbno1Q689Z5 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Sbno1Q689Z5 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Sbno1Q689Z5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Sbno1Q689Z5 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Sbno1Q689Z5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Sbno1Q689Z5 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Sbno1Q689Z5 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Sbno1Q689Z5 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Sbno1Q689Z5 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Sbno1Q689Z5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Sbno1Q689Z5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Sbno1Q689Z5 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Sbno1Q689Z5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Sbno1Q689Z5 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Sbno1Q689Z5 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Sbno1Q689Z5 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Sbno1Q689Z5 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbno1Q689Z5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms