Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Sdc3Q64519 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sdc3Q64519 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sdc3Q64519 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sdc3Q64519 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sdc3Q64519 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sdc3Q64519 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Sdc3Q64519 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms