Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Col4a5Q63ZW6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Col4a5Q63ZW6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Col4a5Q63ZW6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Col4a5Q63ZW6 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Col4a5Q63ZW6 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Col4a5Q63ZW6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Col4a5Q63ZW6 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Col4a5Q63ZW6 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Col4a5Q63ZW6 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Col4a5Q63ZW6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Col4a5Q63ZW6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Col4a5Q63ZW6 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Col4a5Q63ZW6 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Col4a5Q63ZW6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms