Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms