Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Bbs12Q5SUD9 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Bbs12Q5SUD9 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms