Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Sft2d1Q5SSN7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms