Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shank3Q4ACU6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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