Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ulk4Q3V129 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ulk4Q3V129 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms