Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usp48Q3V0C5 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Usp48Q3V0C5 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Usp48Q3V0C5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Usp48Q3V0C5 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Usp48Q3V0C5 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp48Q3V0C5 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Usp48Q3V0C5 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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