Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gm28047Q3US59 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm28047Q3US59 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gm28047Q3US59 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gm28047Q3US59 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gm28047Q3US59 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gm28047Q3US59 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gm28047Q3US59 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm28047Q3US59 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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