Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Znf48Q3US17 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Znf48Q3US17 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Znf48Q3US17 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Znf48Q3US17 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Znf48Q3US17 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Znf48Q3US17 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Znf48Q3US17 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Znf48Q3US17 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Znf48Q3US17 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Znf48Q3US17 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Znf48Q3US17 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Znf48Q3US17 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Znf48Q3US17 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Znf48Q3US17 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Znf48Q3US17 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Znf48Q3US17 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Znf48Q3US17 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Gm42822-201ENSMUST00000200507 1529 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Znf48Q3US17 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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