Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tmem253Q3UNB8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms