Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

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Length 985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc33Q3ULW6 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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