Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJK4

Gtpbp2, GTP-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp2Q3UJK4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gtpbp2Q3UJK4 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gtpbp2Q3UJK4 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gtpbp2Q3UJK4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gtpbp2Q3UJK4 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Gtpbp2Q3UJK4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gtpbp2Q3UJK4 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gtpbp2Q3UJK4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gtpbp2Q3UJK4 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gtpbp2Q3UJK4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gtpbp2Q3UJK4 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Gtpbp2Q3UJK4 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gtpbp2Q3UJK4 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms