Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf224Q3UIW8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf224Q3UIW8 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms