Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hvcn1Q3U2S8 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms