Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RubcnlQ3TD16 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RubcnlQ3TD16 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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