Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms