Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbtb38Q3LR78 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms