Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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