Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cers3Q1A3B0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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