Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
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Rpusd2Q149F1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Rpusd2Q149F1 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpusd2Q149F1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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