Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Spatc1Q148B6 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Spatc1Q148B6 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Spatc1Q148B6 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Spatc1Q148B6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Spatc1Q148B6 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Spatc1Q148B6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Spatc1Q148B6 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Spatc1Q148B6 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Spatc1Q148B6 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Spatc1Q148B6 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Spatc1Q148B6 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms