Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rundc1Q0VDN7 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms