Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

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Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Neurl1bQ0MW30 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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Neurl1bQ0MW30 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Neurl1bQ0MW30 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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Neurl1bQ0MW30 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Neurl1bQ0MW30 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Neurl1bQ0MW30 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Neurl1bQ0MW30 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Neurl1bQ0MW30 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Neurl1bQ0MW30 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Neurl1bQ0MW30 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Neurl1bQ0MW30 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Neurl1bQ0MW30 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Neurl1bQ0MW30 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms