Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tgm3Q08189 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tgm3Q08189 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms