Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Msx2Q03358 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms