Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd1Q01822 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms