Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Top2aQ01320 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms