Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HmgcrQ01237 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HmgcrQ01237 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HmgcrQ01237 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HmgcrQ01237 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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HmgcrQ01237 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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HmgcrQ01237 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HmgcrQ01237 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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HmgcrQ01237 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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HmgcrQ01237 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HmgcrQ01237 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HmgcrQ01237 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HmgcrQ01237 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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HmgcrQ01237 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HmgcrQ01237 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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HmgcrQ01237 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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HmgcrQ01237 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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HmgcrQ01237 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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HmgcrQ01237 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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HmgcrQ01237 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms