Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms