Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LystP97412 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LystP97412 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LystP97412 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LystP97412 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LystP97412 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LystP97412 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LystP97412 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LystP97412 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
LystP97412 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LystP97412 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LystP97412 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LystP97412 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LystP97412 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LystP97412 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LystP97412 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LystP97412 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LystP97412 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LystP97412 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LystP97412 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LystP97412 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LystP97412 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LystP97412 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LystP97412 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LystP97412 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LystP97412 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LystP97412 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LystP97412 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms