Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps3aP97351 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms