Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Irx3P81067 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms